表題のご質問は、一般の方が作成した図面でも申請は可能かという意図です。
ご自身で手続を行いたい方のケースです。
まず、開発許可など法令で図面作成が1級建築士(土地の規模による)などと規定されているケースがあります。
その場合は、まず素人の作成できる図面ではありません。
次に、農地転用や建築許可申請です。
1からご自身で作成するのは、まず無理だと思います。
おそらく、1からご自身で図面を作成するというより、以前、土地家屋調査士や設計士が作成した図面をお持ちで利用したいという意図でしょう。
これについては、ケースバイケースです。
申請先の農業委員会や県民局で、求められる図面を確認します。
注意が必要なのは、上記申請は図面の修正を求められることが多いため、対応できなければいけません。
申請後、図面修正を求められても対応できないようであれば、最初から専門家に依頼したほうが手間やストレスが省けると思います。